Les organismes planctoniques sont à la base de la chaine trophique. En étudier leur diversité est la première étape à la compréhension de la complixité du milieu aquatique.

Les organismes planctoniques sont échantillonsé via différentes méthodes comme les traits de plancton verticaux et horizontaux. Les échantillons sont par la suite stockés avec une solution à base de formol.

Anciennement, les échantillons étaient analysés par des spécialistes. Ils identifiaient et dénombraient les individus présents dans chaque échantillon. Des outils de classifications automatiques ont été mis au point afin de faciliter l’identification et le dénombrement des individus. De plus, le temps d’analyse est plus court qu’une identification manuelle.

Les échantillons sont premièrement numérisés. Chaque image est decoupé en une série de vignettes sur lesquelles une série de variables sont mesurées. Toutes ces variables sont consignées dans des jeux de données.

Les méthodes et outils employés varient pour numériser, découper et mesurer de nombreux paramètres dans l’identification et le dénombrement d’organismes planctoniques.

Il est dès lors indispensable de trouver des solutions afin de comparer puis de convertir les observations obtenues par chaque méthode.